疾病研究数据库

欧联网5月16日电，欧联社援引法新社报道，当地时间5月15日，世界卫生组织(WHO)敦促各国、企业与研究人员不要藏私，要公开新冠病毒疾病疫情的研究发现。世界卫生组织预计29日推出疫情的全球知识分享平台。世界卫生组织总干事谭德塞。据报道，该平台将成为全球各地人士自愿提供智慧财产权与公开数据的资料库，让所有参与者可从彼此共同对抗疫情所取得的进展中受益。哥斯达黎加总统卡洛斯·阿尔瓦拉多(Carlos Alvarado)率先提出这个构想。他指出，新冠病毒疾病蔓延全球，跟时间赛跑寻觅有效的疫苗、治疗方法与技术之际，大家不能再自私自利了。阿尔瓦拉多在世界卫生组织视讯记者会上说，这个构想是要让全世界的人都能取得不同的防疫进展与创新构想。我们希望把那些创新和技术作为全球公共财，保护人类不再受到疫情威胁。他强调，只有在国际团结合作下，而不是自私自利，才有办法击败新冠病毒。世界卫生组织总干事谭德塞表示，研究人员正以最快速度，试图了解新型冠状病毒并研发疫苗与药物。谭德塞指出，传统的市场模式无法达到满足全球所需的规模。在这种特殊情况下，我们必须在科学发展上卯足全力，提供可扩展、可使用并让世界各地所有人都能同时受益的创新构想。如果我们想要度过这些艰难时刻，国家内部和各国与民营部门之间必须团结合作。谭德塞表示，世界卫生组织已经接受这个有远见的提案，并会在未来数周推出一个平台，针对对抗疫情的现有和全新卫生工具，开放大家共同分享知识、数据及智慧财产权。这项平台将在5月29日正式推出。(孙立农)

现在，只要登录一个网站，你就可以获取超过24000份关于冠状病毒的研究文献。这对于正在研究新冠病毒的科学家来说，是一个省事又省力的好工具。北京时间3月17日，美国多家研究组织人员联合发布了关于冠状病毒的开放研究数据库，该数据库的论文来自同行评审期刊，非同行评审的预印本论文网站bioRxiv和medRxiv等。目前，这个数据库涵盖了SARS-CoV-2（新冠病毒），Covid-19（该疾病的科学名称）和冠状病毒组等多方面内容。也就是说，这个数据库几乎包含了与新冠病毒相关的最全科学文献。同时，这个数据集还能实时更新，发布更多的研究论文。据了解，该数据库是在美国白宫科学技术政策办公室（OSTP）的要求下，通过三个组织之间协作而完成的。其中，美国国立卫生研究院的国立医学图书馆（NLM）提供了对现有科学出版物的访问权限；微软则利用其文献策划算法来帮助查找相关论文；非营利组织艾伦人工智能研究所（AI2）提供了可将研究论文从网页转换为PDF格式的算法处理能力。目前，该数据库可以在AI2的Semantic Scholar网站上找到。Semantic scholar跟谷歌学术搜索功能类似。它是AI2结合了自然语言处理和计算机视觉的新学术搜索引擎。但相比谷歌学术搜索，Semantic Scholar更加精确，简洁明了，它的搜索结果会显示关键信息，例如作者，方法，数据和引文，使科学家可以更轻松地快速评估每篇论文。值得一提的是，AI2还使用ELMo和BERT等最新的自然语言模型来描述论文之间的相似性。同时，该数据库还有一项新功能，可以帮助研究人员，根据自己的兴趣创建个性化的研究摘要。对于科学家来说，他们正在争分夺秒地研究新冠病毒，以期找到阻止其传播的方法和治疗方法。有了这个数据库后，所有研究文献将集合在一处，可以让研究人员利用自然语言处理算法更轻松地挖掘文献资料。OSTP也公开呼吁人工智能的研究人员开发用于文本和数据挖掘的新技术，称这将帮助医学界更快地梳理大量的研究信息。中国生物技术网诚邀生物领域科学家在我们的平台上，发表和介绍国内外原创的科研成果。注：国内为原创研究成果或评论、综述，国际为在线发表一个月内的最新成果或综述，字数500字以上，并请提供至少一张图片。投稿者，请将文章发送至weixin@im.ac.cn。本公众号由中科院微生物研究所微生物资源与大数据中心承办2019年热文TOP101. 逆转2型糖尿病的大牛又发文了：2型糖尿病是简单的疾病，减肥或逆转病情！2. 刚刚，Science发布2019十大科学突破！3. Science重磅！西兰花“唤醒”抗肿瘤基因4. 读者泪目！《柳叶刀》全中文发表中国医学博士「家书」：给父亲的一封信5. 《Science》重磅！汝之“蜜糖”，吾之“砒霜...”6. 喝酒，尤其还脸红的人，或面临更高的痴呆风险7. Nature重磅！第一个完全合成且彻底改变DNA密码的生物诞生了8. 这不是一颗大榛子！Science发表新型口服胰岛素，或将取代传统注射9. Science为防秃顶支招：先从不脱发开始...10. 改变精子速度，可以影响后代性别？

为加强和发挥健康医疗大数据作为国家战略性资源的作用，高效推展专科领域医疗大数据标准化建设，12月11日上午，由国家卫生健康委能力建设和继续教育中心(简称中心)主办的肝胆疾病标准数据库建设项目启动会在京隆重召开。这是我国首个系统性疾病标准化大数据库建设项目。国家卫健委规划司刘文先副司长、国家卫健委能力建设和继续教育中心杨爱平主任、清华大学精准医学研究院董家鸿院士，以及来自全国27个省、56家医院的百余位医学及人工智能专家出席了课题启动会，大家建言献策，满怀热情地投身于数据库建设工程，期望以健康大数据驱动提升中国肝胆疾病的临床研究和诊治水平。刘文先副司长在致辞中表示，大数据是一种驱动健康医疗服务的新动力，也是一种健康科技创新发展的新思维，健康医疗卫生事业必须与大数据进行充分融合与创新。他指出，此项目旨在搭建我国目前规模最大、最具代表性的肝胆疾病标准数据共享平台，是一项具有重大意义的科技工程。健康医疗大数据研究一定要强化基础性平台和核心技术攻关，应着力建立健全健康医疗大数据质量标准、开放共享、数据安全保障法规制度体系，用大数据驱动精准医疗、药物研发和人工智能医疗器械的研发和评价，用大数据推动智慧医疗、数字医疗、医保支付、商业保险等领域的革新发展。“大数据建设需要多家医疗机构联合创新、共建共享，需要大家带着责任心、带着情怀共同去完成。国家卫健委规信司将为标准数据库建设做好服务和支持性工作。”国家卫健委能力建设和继续教育中心杨爱平主任在致辞中表示，开展大数据库建设，是落实国家卫健委信息化工作总体部署和要求的一项务实行动，也是推进健康医疗服务体系供给侧改革的一项重要举措。杨爱平主任指出，启动肝胆疾病标准数据库建设，实现由医学图像数据库向全息临床病例数据库的跨越，旨在为精准医疗、临床研究、卫生决策提供充分的数据支撑，同时更好地服务于专科能力建设和继续教育。杨爱平主任强调，在肝胆疾病数据库建设过程中，中心将始终秉承权威性、科学性、数据临床思维连贯性以及数据新鲜性的特点，整合资源，协同推进，安全、高质、高效地推进大数据库建设，全力打造健康医疗大数据应用与发展的引领示范项目。肝胆疾病标准数据库课题由清华大学精准医学研究院董家鸿院士牵头组织专家团队进行落实，设立肝病内科、肝胆外科、肝脏移植、超声医学、放射医学、病理学、基因组学及人工智能等领域的专家小组，为构建从筛查、诊断、治疗、多学科联合诊疗、慢病管理的全息化肝胆疾病标准数据库奠定了坚实的专业基础。“这项工作对于提升我国肝胆领域的疾病预防、筛查早诊、规范诊疗、精准医疗、临床研究水平都具有重要意义，肝胆疾病的精准化预防、筛查、诊疗和康复都离不开高标准、高质量、全息化大数据支撑。”董家鸿院士在致辞中表示，数据库建设不是仅靠一个机构就可以完成，需要国家权威部门的指导与支持，需要多中心通力合作，需要临床医学、预防医学、大数据、人工智能等领域专家合作制定标准，这是一个划时代的宏大工程!“我们联盟医院会共同发力，遵循‘边建库边应用’的原则，制定务实详细的任务分工和工作计划，推进数据标准化、数据互联共享、人工智能研发应用，将肝胆数据库建设成为国内最好、国际领先的数据库，并以此为基础建立医工结合、医研企融合的肝胆科研平台和创新联盟，拓展健康科技和智慧医疗领域的合作。”会上，多位权威专家学者就数据库建设的课题背景、数据标准、标注标准及收集工作部署等进行了讲解。中心大数据办公室主任马兆毅分别从标准制定、数据收集、数据存储、数据应用等方面，对医学数据库建设的整体要求和作业流程进行了介绍；清华大学精准医学研究院黎成权就肝胆疾病标准数据库建设工作的目标任务和工作计划做了详细介绍；上海交通大学附属瑞金医院严福华教授分享了标准化数据库建设的瑞金经验；清华大学医学院王广志教授为与会者详细讲解了创新医疗器械审评及其对标准数据库的建设要求。

央广网济南3月25日消息（记者桂园）记者从刚刚召开的山东省健康医疗大数据科技创新联盟建设暨专病大数据队列研究工作推进会上获悉，山东省卫健委围绕“五高”疾病，对90个专病大数据队列研究团队进行立项培育，力争在转化医学、临床比较效果研究、个性化精准医学研究等领域实现突破性进展，提升山东重点疾病的研究水平和防治能力，引领全省卫生健康科技创新方式转变。专病大数据队列研究以“发病率高、病死率高、致残率高、医疗费用高、科技支撑作用高”的90种重点疾病为研究方向，涵盖心血管病、脑血管病、糖尿病、肺癌、消化道癌、乳腺癌、脑肿瘤、白血病、阿尔茨海默病、慢性阻塞性肺病等常见多发疾病。多学科交叉、多机构参与是山东专病大数据队列研究的显著特点。据悉，每支专病大数据团队均由知名临床专家领衔，由临床医生、基础研究人员、数据管理人员等组成联合科研团队。大数据管理应用方面得到了山东大学健康医疗大数据研究院、国家超算济南中心等权威专业机构的支持。开展专病大数据队列研究将进一步推进山东健康医疗大数据产业化发展。相关负责人介绍，山东于2017年先期遴选了7个专病大数据队列开展试点，在产业化推广方面已初现效果。山东大学齐鲁医院神经外科李刚团队利用跨组学数据库，初步研发出能够快速检测脑胶质瘤生物标记的纳米微孔基因检测芯片，可进行脑胶质瘤的早诊早治，并指导精准用药。山东大学齐鲁医院消化内科李延青团队开展消化道癌人工智能诊断技术的开发与应用，已申报多项发明专利。山东将于明年初对达到建设标准的专病大数据队列进行挂牌认定，在全省打造满足“山东需求”、具有“山东特色”“山东优势”，并能达到国际一流水准的健康医疗大数据科技创新平台，支撑山东建立大数据驱动的医学研究体系。

图片来源：美国能源部人类基因组计划/维基共享周六，中国启动了第一个旨在诊断儿童罕见疾病的重大项目。中国的儿科专家将开始使用全基因组测序（WGS）的技术来建立罕见和未确诊病症（包括精神障碍和身体缺陷）的数据库。全基因组测序（WGS），或称为个人DNA图谱绘制，在近年来引起了中国投资者的关注。去年，中国的基因测序产业产值增长超过68亿人民币（10.8亿美元）。但是没有权威对其应用的支持，全基因组测序（WGS）很难发挥更大的临床作用，该项目负责人，新华医院的儿科医生余永国说。在医院发给Sixth Tone的声明中，余说，“早期的基因测序方法未能对一些罕见疾病给出明确的诊断，但这一次我们将使用WGS帮助检测过去无法辨别的复杂遗传变异，我们有望通过利用这项技术大大提高罕见疾病的诊断率”。据世界卫生组织报道，全球范围内有超过6000种已确诊的罕见疾病，即每10000人中不超过5人会受到影响的疾病。大约80%的罕见疾病是由遗传缺陷引起的，患有罕见病的人中，有一半在出生时或者幼儿时期就首次表现出了症状。然而，大多数罕见疾病的成因尚不清楚。2011年，上海复旦大学出生缺陷研究中心估计中国有约1680万人患有罕见疾病。2016年的数据显示，仅上海就有约20万人罕见病患者——其中一半是儿童。据Sixth Tone的姊妹刊物The Paper报道，这些患者中只有不到5%正在接受有效治疗。“目前，罕见疾病的诊断比治疗更重要，”余说。他解释说，通过使用WGS数据来探索这些疾病的发病机制，医学研究人员能够确定更好的治疗计划的理论基础，全国各地的儿科部门将应用共同的临床标准进行诊断。余补充道，最终中国将拥有一个包含罕见病患者遗传信息的综合数据库。余医生表示，虽然他和他的团队认为WGS是诊断罕见疾病的创新并可靠的方法，但他们也有责任保护患者的隐私免受参与该项目的医院、研究人员和公司的影响。他说：“只有得到患者及其家属的同意，才能授予大数据联盟成员访问数据的权利，并且该数据只能用于科学目的。”翻译：高政圆审校：董子晨曦

来源：经济日报-中国经济网经济日报-中国经济网12月23日讯（记者 韩璐） 12月19日在京召开的“智慧医疗2020·中国智慧医院联盟年度论坛暨DH400工作组成立会议” 发布了国家肝胆疾病数据库，作为中国首套肝胆疾病标准数据规范，将填补医疗人工智能在肝胆疾病领域的标准空白，成为新的行业级标准。 据介绍，国家肝胆疾病数据库的建设工作于一年前启动，目前已经收集五千多例标准全息数据。 会上，中国工程院院士董家鸿表示，数字经济、智慧医疗是健康中国战略乃至更长一段时期的时代特征和发展大势，也是当前新发展理念和新发展格局的重要标志。医疗卫生事业和医药健康产业的数字化升级，是我们追求高质量发展的过程中面临的重大历史机遇和挑战。 国家卫生健康委员会规划发展与信息化司副司长刘文先表示，在“健康中国”战略实施过程中，全面健康信息化，新一代信息技术的支撑引领作用非常重要，我们要加强新一代信息技术和医药卫生行业的深度融合，优化资源配置，提高服务效率，重塑医疗卫生行业的管理和服务模式。中国信息通信研究院副总工程师王爱华谈及智慧医疗产业的需求现状表示，数据显示，目前国内互联网医院挂牌数量已经达到900多家，跟去年同期相比涨幅超400%，第三方互联网服务平台的诊疗咨询量也比去年同期增长了20多倍。 本次会议由中国智慧医院联盟、清华大学人工智能研究院、中关村科技园区大兴生物医药产业基地管委会共同主办，还宣告了DH400工作组成立。据介绍，DH400工作组是一个由国内国际重点医院、医药健康企业、人工智能企业、金融机构和行业专家等组成的成果转化平台，提供成果转化的全流程跟踪服务，加快创新成果转化落地的效率，打破医药健康成果转化的瓶颈。【来源：中国经济网】声明：转载此文是出于传递更多信息之目的。若有来源标注错误或侵犯了您的合法权益，请作者持权属证明与本网联系，我们将及时更正、删除，谢谢。 邮箱地址：newmedia@xxcb.cn

新华社照片，拉萨，2018年3月23日西藏：建设完善全人群疾病数据库3月23日，西藏自治区疾控中心实验室工作人员正在进行包虫病免疫吸附试验。西藏于2017年11月底全面完成包虫病全人群筛查工作。在免费开展包虫病筛查的同时，西藏拉萨市、山南市、昌都市等地将重点防控的大骨节、风湿病、结核病、艾滋病、病毒性肝炎等重点疾病一并纳入筛查项目，进一步完善西藏境内全人群疾病数据库，为西藏全人群疾病分布、疾病种类等病理分析提供基础数据保障。新华社记者 晋美多吉 摄

图为孙庆荣。中国药科大学供图摄中新网南京3月26日电 (徐珊珊 通讯员 姜晨 姜佳彤)中国药科大学26日消息，该校基础医学与临床药学学院2018级药理学专业博士生孙庆荣带领其团队成功开发了一个冠状病毒资源数据库。据了解，这是一个专为冠状病毒科研工作者开发的资源数据库平台，旨在使学者可以便捷迅速地查找冠状病毒(包括新冠病毒)的相关研究文献，准确掌握并深入了解冠状病毒的起源、研究历史、研究进程、研究热点等。尽管从建立到完善仅32天，但数据库中整合的文献资源数却不容小觑。截至3月22日，数据库里共收集了9556篇英文研究文献、3052篇中文研究文献、25个英文数据资源平台、6个中文数据资源平台以及18个与病毒学相关的主要分析工具等。值得一提的是，数据库中的研究报告和综述性论文均以时间轴为核心编排展开，从最早的1965年起开始追踪，直到2020年，时间跨度长达55年，从而最大限度地方便科研工作者基于时间顺序查阅相关文献资料，快速了解冠状病毒在每个年份的研究状况和进程，以此追根溯源，深入探究。冠状病毒资源数据库。中国药科大学供图 摄谈及数据库的开发初衷时，孙庆荣坦言，灵感主要来源于自己的导师。由于是跨领域研究，孙庆荣坦言，在研究过程中发现自己对病毒的前期研究和分析不那么娴熟。于是，在导师来茂德的鼓励下，他便萌生了开发创建一个整合冠状病毒资源和相关研究数据库的想法，方便病毒学专业以外的科研人员从事相关研究。于是，在各自居家隔离的情况下，孙庆荣与来自药学、临床药学、中药学、生物制药等多个专业的11位本科生迅速组建了团队。孙庆荣坦言，冠状病毒资源数据库的建立是一个并不轻松的过程，在数据库服务器基础环境的构建、数据整合、信息展示等环节都曾遇到过各种各样的困难。面对诸多的“拦路虎”，孙庆荣通过对数据板块合理的规划，高效带领团队进行数据收集和整合。“虽不能到前线，但作为一名药学科研工作者，希望能利用专业所长为疫情防控尽自己的一份绵薄之力。”孙庆荣说。

新华社照片，拉萨，2018年3月23日西藏：建设完善全人群疾病数据库3月23日，西藏自治区疾控中心实验室工作人员正在进行尿氟检测。西藏于2017年11月底全面完成包虫病全人群筛查工作。在免费开展包虫病筛查的同时，西藏拉萨市、山南市、昌都市等地将重点防控的大骨节、风湿病、结核病、艾滋病、病毒性肝炎等重点疾病一并纳入筛查项目，进一步完善西藏境内全人群疾病数据库，为西藏全人群疾病分布、疾病种类等病理分析提供基础数据保障。新华社记者 晋美多吉 摄